Paprasčiausias bandymas su gyvūnais. Vienaląstė povandeninė karalystė. Trumpas dokumento aprašymas

Rezultatai rodo, kad naudojant filogenetinę analizę, siekiant patikrinti lygiagretų genų dubliavimąsi skirtingi tipai gali padėti nustatyti genus, atsakingus už panašias, bet nepriklausomai išsivysčiusias adaptacijas. Galimai generuojant naujus genus, koduojančius baltymus nauja funkcija, ilgą laiką buvo manoma, kad genų dubliavimasis gali prisitaikyti prie jų aplinkos. Tačiau modeliai, pagal kuriuos genų gamyba evoliucijos eigoje paskatino funkciškai naujų genų atsiradimą, tebėra menkai suprantami.

Euglena, skirtingai nei ameba, turi

Taigi daroma prielaida, kad diferencinis genų dauginimasis turi įtakos fenotipinės įvairovės atsiradimui. Kita vertus, galima daryti prielaidą, kad lygiagretus to paties genų rinkinio dubliavimasis gali turėti įtakos prisitaikymui per atstumą. giminingos rūšysį panašias ekologines nišas. Taigi, genų dauginimas gali skatinti tiek skirtingą, tiek konvergentišką evoliuciją fenotipiniu lygmeniu.

Naudodami filogenetinę analizę, nustatėme šių dviejų rūšių genų dubliavimosi laiką, palyginti su jų paskutiniu bendru protėviu, kad ištirtume, kokiu mastu dubliavimas įvyko lygiagrečiai dviejose linijose, kurios nepriklausomai prisitaikė prie panašaus gyvenimo būdo. Kiekvienam šių šeimų genų dauginimuisi filogenetinio medžio šakojimosi tvarka buvo naudojama norint patikrinti hipotezę, kad genų dubliavimasis įvyko prieš paskutinį bendrą dviejų rūšių protėvį.

Nustatyta, kad 56 šeimose vienas ar daugiau genų dubliavimosi pasireiškė nepriklausomai kiekvienoje rūšyje po paskutinio bendro protėvio. Remiantis pastebėtais genų dubliavimosi dažniais po bendro protėvio 645 tirtose šeimose, nepriklausomas genų dauginimasis kiekvienoje rūšyje buvo stebimas daug dažniau, nei tikėtasi atsitiktinai. Šios 56 šeimos apėmė 22 ribosomų baltymų šeimas. Norėdami patikrinti, ar pastebėtas modelis būdingas ribosomų baltymams, tą pačią analizę atlikome iš duomenų rinkinio neįtraukę ribosomų baltymų.

Šiuo atveju taip pat buvo pastebėtas nepriklausomas dviejų rūšių genų dauginimasis tose pačiose šeimose daug didesniu mastu, nei tikėtasi atsitiktinai. Buvo stebimos atskiros visų baltymų duomenų rinkinio ir duomenų rinkinio, išskyrus ribosomų baltymus, analizės. Šis rezultatas atitinka hipotezę, kad daugelis buvusių genų buvo dubliuoti per siaurą laikotarpį, kaip tai būtų poliploidizacijos atveju.

Tačiau net genų dubliavimo laiko intervalas blokuose buvo toks didelis, kad suabejotų hipoteze, kad jie visi buvo dubliuoti tuo pačiu metu. Hipotezė apie vienodą dispersiją visose trijose grupėse buvo atmesta. Atsižvelgiant į didelį genų, turinčių esmines ląstelių ciklo funkcijas, dažnį 56 nepriklausomai besidubliuojančiose šeimose, panašu, kad genų padvigubėjimas šiose šeimose atsirado dėl dviejų linijų prisitaikymo prie vienaląsčių mielių gyvavimo ciklo. Toks poliploidizacijos įvykis galėtų būti pasikartojančių genų, kuriuos šis grybelis galėtų panaudoti prisitaikydamas prie vienaląsčio gyvenimo būdo, šaltinis.

Todėl mūsų rezultatai rodo, kad nors poliploidizacija gali būti žaliava adaptacinei evoliucijai, ji jokiu būdu nėra būtina kelių naujų genų, turinčių naujas funkcijas, atsiradimui. Taigi, genų dubliavimosi pikas evoliucijos istorijoje neturėtų reikšti poliploidizacijos įvykio, o tai prieštarauja kai kurių neseniai atliktų darbų pasekmėms. Dauguma pasikartojančių genų ilgainiui prarandami, tačiau dublikatai, kurie specializuojasi prisitaikant prie svarbių naujų funkcijų, turi daug didesnę galimybę būti išsaugoti.

Kiekvienoje iš dviejų mielių rūšių, po paskutinio bendro protėvio, a reikšminga suma nauji pasikartojantys genai. Mūsų rezultatai rodo, kad toks išlaikytų genų dubliavimosi pikas yra adaptyvios evoliucijos signalas genomo lygiu.

Be to, mūsų rezultatai rodo naujas požiūris nustatyti genus, kurie gali būti susiję su dominančiomis fenotipinėmis adaptacijomis. Jei du yra toli susijęs organizmas savarankiškai sukūrė panašias fenotipines adaptacijas, filogenetinės analizės gali būti naudojamos, kaip ir šiame tyrime, siekiant nustatyti genų šeimas, kurios dubliuojamos nepriklausomai dviejose linijose. Tokios genų šeimos savo ruožtu suteiks genų kandidatų rinkinį, kad suprastų abiejų linijų molekulinį adaptacijos pagrindą.

Ieškokite sekų ir homologijos

38 pilnų bakterijų genomų ir visų turimų sekų iš kitų reprezentatyvių organizmų rinkinio proteomų duomenų rinkinys buvo gautas iš Nacionalinis centras biotechnologinė informacija. Po to, kai kiekvienam genomui buvo nustatytas nesuformuotas proteomas, kiekvienas baltymas buvo naudojamas homologijai tarp likusio proteomo ieškoti. Taip pat kiekvienas neproduktyvaus žmogaus baltymo proteomo baltymas buvo išbandytas prieš visus baltymus iš kitų genomų. Griežtas paieškos kriterijus homologiškais identifikuoja tik tuos baltymus, kurie turi homologiją per visą baltymo ilgį, o ne homologiją tik vienoje ar keliose srityse.

Atsižvelgiant į visas homologinių baltymų poras, baltymų šeimų paieškai buvo naudojamas „vienos linijos“ metodas. Šis žingsnis sugrupuoja genus, kurie dalijasi homologija. Šis laiko dubliavimo įvykių metodas neprisiima pastovaus molekulinės evoliucijos greičio ir nepriklauso nuo medžio įsišaknijimo.

Padarėme išvadą, kad prieš kladogenetinį įvykį dubliuotas genas, jei vidinė šaka, palaikanti šį dubliavimą, buvo žymiai išlaikyta. Puasono aminorūgščių evoliucijos modelis buvo naudojamas statant tiesinius medžius. Ribosominiai baltymai nebuvo naudojami atliekant tiesinę medžių analizę, nes šių baltymų aminorūgščių sekos visose rūšyse buvo vienodos arba beveik vienodos, todėl neįmanoma įvertinti skirtumo laiko. Taip pat neįtrauktos kitos šeimos, kuriose tos pačios rūšies aminorūgščių sekos buvo identiškos.

Kiekvienoje rūšyje reikšmingo skirtumo tarp dviejų grupių vidurkių nebuvo. Kadangi nebuvo reikšmingo skirtumo tarp dviejų grupių kiekvienoje rūšyje, abi grupės buvo sujungtos į rūšis, kad būtų galima vėliau analizuoti. Dispersijos homogeniškumo Levene testas atmetė hipotezę apie dispersijos homogeniškumą tarp šių grupių, tačiau hipotezė apie dispersijos homogeniškumą tarp 1 ir 3 grupių nebuvo atmesta. Į puodą supilkite porą litrų vandens su sauja žemės ir virkite 5 minutes.

Leiskite jam atvėsti ir nupilkite, tada filtruokite vandenį ir išmeskite likusias žemes. Taigi jūs gausite praturtintą kultūros terpę mineralinės druskos. Leiskite skysčiui stovėti bent vieną dieną, kad atmosferos dujos vėl ištirptų į jį.

Vienaląsčių organizmų maisto objektai yra

Šie mikroskopiniai dumbliai mėgsta gyventi mažuose lietaus vandens telkiniuose. Ištikus bėdai, jie linkę likti apačioje ir pasidaro raudoni. Todėl juos lengva rasti dėl aiškiai matomų raudonų dėmių, kurios susidaro baltų indų dugne ir šonuose arba ant dangčio. Jei nerandate, palikite baltą plastikinį dubenį lauke svarus vanduo arba lietaus vanduo.

Jei pasiseks, po kelių dienų ant dubens sienelių ir dugno pamatysite raudonos spalvos pėdsakus. Surinkite dalį šių rausvų nuosėdų ir sudėkite į stiklainį arba mėgintuvėlį, kuriame yra lietaus vanduo, praturtintas anksčiau aprašyta maža auginimo terpe. Vietoj lietaus vandens taip pat galite naudoti vanduo iš čiaupo jei paliksite vieną dieną, kad jame esantis chloras išgaruotų. Uždarykite vamzdelį dangteliu, į kurį patenka oro, bet ne dulkių. Labiausiai tikėtina, kad bus kitų mikroorganizmų.

Jei norite pavaizduoti skaitinį mėginio augimą, paimkite lašelį kultūros ir stereoskopiniu mikroskopu suskaičiuokite hematokokų skaičių. Kartokite šią procedūrą kiekvieną dieną. Nubraižykite diagramą ir apskaičiuokite langelio dubliavimo laiką. Pastebėsite, kad jis vis labiau šarmės. Tiesą sakant, šie mikroskopiniai dumbliai pašalina anglies dioksidą, kuris rūgština vandenį. Kartkartėmis įlašinkite kelis lašus gazuoto mineralinis vanduo, kuriame yra daug ištirpusių anglies dioksidas, į kultūrą.

Miego ligą sukelianti tripanosoma nešiojama

Padidėjęs šarmingumas sukels sunkumų pasėliui. Norėdami išspręsti šią problemą, įlašinkite kelis lašus acto. Kad kultūros pH išliktų stabilus, įpilkite buferinio tirpalo. Vamzdis prasidėjo ir baigėsi kelių litrų tūrio stikliniame inde, kuriame buvo nedidelis vandens siurblys akvariumams. Turbūt geriau būtų vartoti alkoholį arba sūrus vanduo. Šie dumbliai auginami gaminant astaksantiną – karotinoidą, turintį antioksidacinių savybių. Sunku įsivaizduoti, kad nuotraukoje esantis kempinėlis iš tikrųjų susideda iš vienos ląstelės, ar ne?

Trumpas dokumento aprašymas

Susipažinkite su didžiausiu pasaulyje vienaląsčiu organizmu, kurio maksimalus skersmuo ne mažesnis kaip 20 cm! Mėginiai buvo blogos būklės ir padalintas į daug dalių. Murray ir Brady ką tik atrado pirmąjį vienaląstį ksenofioforą. Jų charakteristika susideda iš to, kad juos sudaro klampus skystis, vadinamas citoplazma, kuriame yra daug branduolių, tolygiai paskirstytų visame perimetre. Ląstelė šakojasi ir skyla į šimtus vamzdžių, kurie išsišakoja ir susijungia į itin sudėtingą tinklą.

Kiekvienas žmogus turi keletą branduolių, išsibarsčiusių per vamzdelius. Didėjant bandymo dydžiui, ląstelė palieka savo dalis, kurias gali užfiksuoti daugybė mažų gyvūnų, pavyzdžiui, nematodai. Pavyzdžiui, mes neturime supratimo apie rūšių ir jų dauginimąsi gyvenimo ciklas apskritai. Ksenofioforai yra Foraminifera genties dalis. Taip pat nežinoma, kaip organizmas maitinasi. Tačiau tyrimai parodė, kad ksenofenopai turi didelė koncentracija lipidų citozolyje, o tai rodo, kad jie gali maitintis bakterijomis iš nuosėdų, sudarančių smėlio vamzdelius.